El país ibérico se incorporó como socio extrarregional del BCIE en 2005. Al cierre de 2023, cuenta con un capital suscrito de US$280 millones, con pagos de capital por US$70 millones, ocupando una participación accionaria del 4.19%.
El vínculo entre el BCIE y España facilita apoyo financiero a la región centroamericana, a través de la suscripción de varios contratos de cooperación financiera por un monto de US$702.7 millones. De estos fondos, US$564.4 millones han sido canalizados mediante acuerdos suscritos con el Instituto de Crédito Oficial (ICO). Los restantes US$138.3 millones provienen del convenio de Conversión de Deuda España–Honduras, con el Ministerio de Economía y Empresa. Durante 2023, se firmó un convenio de financiación con el ICO por un monto de hasta US$150 millones, destinado a financiar operaciones de inversión y/o liquidez y de exportación/importación de empresas españolas en los países miembros del BCIE. También en 2023, se captó un total de US$115.3 millones del ICO, entre todos los convenios vigentes entre ambas instituciones.