El BCIE procura, con diversos programas e inversiones, contribuir al desarrollo, crecimiento y productividad del sector empresarial MIPYME, a través de 17 Programas de Crédito Intermediario, en áreas de la agricultura, vivienda, comercio, educación, innovación, energía e infraestructura.

Estas líneas de crédito son un esfuerzo más del BCIE demostrando el compromiso por apoyar las MIPYMES con los emprendedores tanto del medio rural como urbano, como uno de los ejes estratégicos de desarrollo social y competitividad con gran impacto en la generación de empleo y apoyo a la reducción de la pobreza.

El trabajo interinstitucional y la articulación de los servicios crediticios abordados de forma integral en beneficio de las MIPYME, es un pilar fundamental para el crecimiento económico regional, priorizando en el acceso a mercados a través la bancarización empresarial, la creación de encadenamientos productivos eficientes y el apoyo conjunto entre el sector cooperativo y organismos multilaterales. 

En la actualidad del BCIE es el organismo que brinda mayor apoyo al sector MIPYME en la región centroamericana.